這趟北巡孝文帝在代北轉了一大圈，從二月到十月，足足待了九個月之久，一切安排妥當後，他才到太廟遷移神主。

列位祖宗，你們安心歇著吧，朕要走了，你們不要怕，墳就不遷了，牌位朕帶走就行了。

孝文帝畢竟是性情中人，不像幾百年後的金海陵王完顏亮為了遷都，把列位先帝的皇陵都遷到了北京房山，我看你們走不走！

祖宗們已經入土為安，可以享受留在金陵的特殊政策，但活著的人這不還沒安呢，都要跟著走，除了鎮守六鎮的將領外，其餘的百官都要到洛陽去。

處理完平城的事兒後，孝文帝最後一次到永固陵向馮太后敬獻花籃，同時也是向她辭行，潛臺詞就是永別了，太后，朕要食言了，朕這一走恐怕就再也回不來了，您自己保重吧。

孝文帝巡幸鄴城時，有一個神秘之人幾乎同時到達了鄴城，他是逃命逃到這裡的，此人名叫王肅。

王肅可不是普通人，他是東晉開國元老王導的後裔，出身琅琊王氏。王肅的父親王奐本是劉宋官員，南齊取代劉宋後，王奐也成了南齊官員。齊武帝蕭賾即位後，任命他為雍州刺史，雍州寧蠻長史劉興祖不知從何得知王奐家裡有稀世珍寶和氏璧，便向齊武帝身邊的紅人曹虎密報。曹虎是個貪婪之徒，他多次向王奐索要和氏璧，都被王奐拒絕了。

王奐後來得知是劉興祖在裡面興風作浪，一怒之下就狀告劉興祖煽動山中蠻族叛亂。齊武帝命王奐押解劉興祖進京審訊，結果王奐居然私自把劉興祖殺了，這下把齊武帝給惹火了，命曹虎配合禁衛軍前往雍州捉拿王奐。

王奐本無反意，被逼無奈只得奮起反抗，結果他和兒子王彪都被殺害，王家也慘遭滅族，唯獨王奐的另一個兒子王肅逃了出去。茫茫天地之間除了北方的北魏，王肅不知道哪裡還有自己的容身之地。走投無路的王肅不得不一路向北，逃往北魏境內。

王肅逃到鄴城後，正巧孝文帝也在這裡巡視，王肅想方設法求見孝文帝，而孝文帝聽說王肅來投也非常高興，便接見了這位頗有盛名的南朝經學名士。

王肅向孝文帝講述了王家的遭遇，其慘狀令孝文帝為之落淚，王肅見孝文帝都為王家落淚，這令他非常感動。王肅堅信孝文帝是個仁愛有作為的君主，於是他收起悲痛，轉而與孝文帝談古論今，二人促膝長談，有種相見恨晚的感覺。

王肅將南齊國內的情況向孝文帝作了彙報，描述了他一路北逃的所見所聞，特別是南齊底層社會的真實情況。王肅分析南齊朝局動盪不安，只怕大亂將至，而且已有滅亡之兆，他力勸孝文帝出兵南征，統一江南。

王肅的話令孝文帝熱血沸騰，謀求統一天下的心情更加迫切。

就在王肅北逃前後，齊武帝病逝，由於他的長子蕭長懋早死，這皇位便落到了蕭長懋的兒子蕭昭業手裡。

蕭昭業是中國歷史上著名的昏君，然而當時他卻把自己打扮成一個孝子賢孫的模樣，欺騙住了齊武帝。

王肅身懷血海深仇，一再向孝文帝建言及早出兵南征，攻滅南齊統一南方，這話令孝文帝很動心。不過此時他的重心仍放在遷都和後續的漢化改革上面，南征一事還不便於實施，時機不成熟。

王肅也理解孝文帝的難處，便沉下心來輔佐孝文帝，希望有朝一日能報仇雪恨。孝文帝對王肅非常器重，一開始便封他為輔國將軍、大將軍長史，賜爵開陽伯。王肅誠惶誠恐，以初到北魏，寸功未建為由辭謝開陽伯爵位。

孝文帝在離開平城前，召東陽王拓跋丕談話，拓跋丕此時已經七十歲高齡，是拓跋皇族裡資歷最老的一位。可想而知這位老王爺的地位有多高，孝文帝把他找來定然是有大事要商議。

果不其然，孝文帝開門見山任命拓跋丕留守平城，朝廷要遷往新都洛陽，這平城又不能放棄，必須選一個德高望重的宗室重臣坐鎮。思來想去，孝文帝最終還是選中了拓跋丕。

之所以選拓跋丕，孝文帝也有一些不便挑明的考慮。

這拓跋丕乃是反對遷都的保守貴族代表人物，他堅決反對遷都以及漢化改革，對孝文帝推動的遷都改革大業頗為不滿。一批守舊貴族紛紛聚集到他身邊抱團取暖，這幫人明裡暗裡抵制反對孝文帝，這令他很是頭痛。

這幫人都是皇親國戚，你又不能都給得罪了，思前想後孝文帝只能暫時妥協，為了穩定大局，命拓跋丕留守平城。拓跋丕本來就不想去洛陽，聽到這個訊息真是求之不得，他非常高興。

孝文帝讓拓跋丕留守平城也有安撫守舊貴族的打算，這幫人人多勢眾，一時半會兒還不能動他們。

安排好平城的事務後，孝文帝準備啟程回洛陽了。

臨走前，他命五弟高陽王元雍、鎮南將軍於烈去太廟護送列祖列宗的牌位先行出發。隨後孝文帝親率首批南遷的文武官員、部分後宮嬪妃啟程南下，官員家屬以及自願南遷的百姓也陸續出發。

這場大遷徙歷時三年，直到太和十九年（495年）九月，洛陽宮室初步竣工，文武百官和六宮嬪妃全部遷到洛陽，宣告遷都完成。