運動療法是現代心臟康復五大處方的主要內容之一。運動療法具有獨立的降低心血管疾病風險的作用。歐美及我國心血管疾病二級預防指南均強調運動療法的價值，IA級（最高強度/最強證據）推薦臨床醫生不僅要給患者提供藥物處方，同時還應提供運動處方。適宜的運動訓練，可有以下作用：

改善血管內皮功能

運動透過增加血管壁血流介導的剪下力，改變血管內皮功能，增加一氧化氮的合成、釋放和活性；透過促進內皮祖細胞、間充質幹細胞動員，促進血管新生和內皮修復。

抗炎作用、延緩動脈硬化

1、抗炎作用：有氧運動可降低血中C反應蛋白水平，促進還原型乙氨醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸的生成，增加機體抗氧化能力。

2、延緩動脈硬化：運動可降低Ⅰ型和Ⅲ型膠原纖維以及轉化生成因子B的表達；減少糖基化終末產物生成，延緩動脈硬化。

改善心肌重構、降低血栓栓塞風險

1、改善心肌重構：有氧運動可減輕梗死後心肌組織重塑，改善心肌的順應性，改善鈣離子調節功能和受損心肌的收縮能力，降低心肌的氧化應激水平，改善迴圈系統中的炎症因子；增強線粒體活性，增加ATP的生成；延緩心肌纖維化。

2、降低血栓栓塞風險：長期規律的有氧運動能夠降低易損斑塊破裂後的血栓栓塞風險，其機制包括增加血漿容量、降低血液粘滯度、減弱血小板聚集、提高血漿組織纖溶酶原啟用水平、增加纖溶能力。

改善心肌缺血，降低猝死風險

長期規律的有氧運動可降低運動時的心率、收縮壓，降低心肌耗氧量，提高冠心病患者運動誘發缺血的閾值；還可以產生缺血預適應，提高心肌對缺血的缺氧的耐受力。透過改善冠狀動脈彈性、改善內皮產生的血管舒張功能，增加病變血管的管腔面積、心肌毛細血管密度，促進側支迴圈生成，達成提高冠狀動脈血流量的目的。