司令礁位於南沙群島東南部，在南華礁的東南方，隸屬於海南省三沙市永興島管轄。

司令礁北距永興島980公里， 東距巴拉望島220公里， 東北距離菲律賓首都馬尼拉920公里， 西面距離越南金蘭灣 760公里。

司令礁屬於單體環礁，為一個長形環礁，東西長16公里，最寬處約3公里，

面積約27平方公里，其中礁坪面積約20平方公里。

從衛星圖上可以看出司令礁沙洲的面積較大。

如果考慮到礁盤深度、礁坪集中度、礁坪寬度以及取沙難易程度，司令礁的填海造島潛力將僅次於柏礁。

司令礁沒有 口門發育，船隻不能入瀉湖。

島礁發育有兩個瀉湖，像一副“眼鏡”。

瀉湖水深5。5-14。5米，中央有高0。6米的沙洲將淺湖一分為二，

我國漁民向稱眼鏡，類似南海礁之形。東端有礁 高出海面0。3米。

礁盤外坡急陡，水深突變為2，000米。

司令礁附近 盛產馬蹄螺、海參等，我國漁民常常到司令礁海域捕撈。

司令礁中部礁坪完整，長約5公里，平均寬度約為1。7公里，

面積約為8平方公里，而且東部小瀉湖完全可以建設成地下水庫或者油庫，

這樣 整個島礁的東部都可以開發成陸地。

司令礁大瀉湖邊緣 南窄北寬，南部寬約460米，北部寬約700米，

西端三角區域寬度則在1。4公里左右，這樣的條件已經好於美濟島。

而且司令礁瀉湖深度最深不過15米，取沙十分方便，

完全可以建成一個面積達15平方公里的大島，面積將是現在南沙群島陸地面積的總和。

司令礁地處南華水道和南沙海槽 國際航道交匯處，

能夠有效監控兩個水道的過往船隻。

且島礁距離 巴拉巴克 海峽僅200公里，

巴拉巴克 海峽 是我國核潛艇進出太平洋的重要通道。

綜合來看 司令礁自然條件十分優越，地理位置相當重要，開發潛力十分巨大。是南沙群島不可多得的好礁。

1935年中華民國公佈為司令沙洲；

1947年中華民國公佈為司令礁；

1983年中國政府公佈名稱為司令礁。