從紅海山到衣索比亞北部高地，大約在公元前16，000年，人們收集了堅果，草和塊莖作為食物。在公元前13，000至11，000年，人們開始收集野生穀物。這蔓延到了西亞，將其野生穀物，小麥和大麥馴化了。在公元前10，000至8000年之間，東北非洲正在種植小麥和大麥，並從西南亞飼養綿羊和牛。非洲的潮溼氣候階段使衣索比亞高地變成了山區森林。滲透說話的人大約在公元前6500-5500年馴化了環境。大約公元前7000年，衣索比亞高地的定居者馴養了驢子，到公元前4000年，馴養的驢已經傳播到西南亞。會說方言的人，在公元前5500年至3500年之間部分遠離牛群，馴化的雞胸草和小米。

在BP的第11個千年，陶器是在非洲獨立發明的，最早的陶器可追溯到公元前9400年，始於馬裡中部。［58］它很快蔓延到整個撒哈拉南部和薩赫勒地區。在西非北部撒哈拉沙漠和薩赫勒地區的草原和大草原上，尼羅撒哈拉沙漠講者和曼地人開始在公元前8000年至6000年之間收集和馴化野生粟，非洲大米和高粱。後來，葫蘆，西瓜，蓖麻子和棉花也被收集了並且被馴化了。人們開始捕獲野牛，並將其放在圓形的荊棘籬笆中，導致馴化。他們還開始製作陶器並建造石頭定居點（例如，蒂希特（Tichitt），瓦拉塔（Oualata）。在因降雨增加而形成的眾多溪流和湖泊中，使用帶骨頭的魚叉捕魚成為一項主要活動。大約在公元前3000-4000年，曼德人被認為是農業的獨立發展者。

在西非，溼相從塞內加爾到喀麥隆迎來了一片不斷擴大的雨林和茂密的熱帶稀樹草原。在公元前9000年至公元前5000年之間，尼日-剛果語使用者馴化了油棕和酒椰棕。馴化了兩種種子植物，即黑眼豌豆和voandzeia（非洲花生），然後是秋葵和可樂果。由於大多數植物都生長在森林中，因此尼日-剛果演講者發明了用於清理森林的拋光石斧。

大多數的南部非洲被佔領的俾格米人與科伊桑誰從事狩獵和採集。他們生產了一些最古老的岩石藝術品。

數十萬年來，撒哈拉沙漠以其繞太陽旋轉（改變了北非季風的位置）而引起的地球軸線的變化（“進動”），以41，000年的週期在沙漠和熱帶稀樹草原之間交替。當北非季風處於最強的年降水量時，撒哈拉沙漠地區隨後的植被增加，從而導致通常被稱為“綠色撒哈拉沙漠”的狀況“。對於相對較弱的北非季風，情況恰恰相反，年降水量減少，植被減少，導致撒哈拉沙漠氣候週期進入了“沙漠撒哈拉沙漠”階段。撒哈拉沙漠已經有數千年的歷史了，並有望在大約15，000年的時間內（公元17，000年）再次變綠

就在撒哈拉沙漠沙漠化之前，在埃及南部發展的社群，即現在的蘇丹，是新石器時代革命的充分參與者，並居住在定居到半遊牧的生活方式中，擁有馴養的動植物。有人認為，巨石發現在Nabta海灘是世界上第一個著名的例子archaeoastronomical裝置，早於巨石陣被一些1000年。有人建議在納布塔海灘觀察到的社會文化複雜性，並由社會內部不同級別的權威所表達，這為納布塔新石器時代社會和埃及古王國的結構奠定了基礎。到公元前5000年，非洲進入了乾旱時期，撒哈拉沙漠地區的氣候逐漸變得更乾燥。人口四處遷出撒哈拉地區，包括前往第二大瀑布下方的尼羅河谷，在那裡他們定了永久性或半永久性的定居點。發生了重大的氣候衰退，減輕了中非和東部非洲的暴雨和持續降雨。