1943年蔣介石、宋美齡有一次去貴陽，當時的蔣並無專機​。前一天，衣復恩奉航委會主任周至柔命令，翌日載蔣介石夫婦由重慶至貴陽。任務重大，衣復恩先飛貴陽，測試航線和場地。第二天，即在C-47運輸機上綁了兩張藤椅，作為蔣氏夫婦的座位。此時的這架飛機，既無空調也不隔音，蔣介石的侍從們分坐機艙兩旁的鋁製座椅，蔣氏夫婦則坐在臨時固定的藤椅上。不過，此次航行非常順利，蔣介石很滿意。此後，衣復恩曾多次以這種簡陋方式，載著蔣介石出巡。

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1945年4月12日，杜魯門贈送一架座機給蔣介石。該機由C-47改裝，機身為銀白色，機內陳設考究而舒適。座椅一律為沙發，前艙為一間辦公室，有一張軟床，另有廁所和簡單的廚具，空調和隔音裝置當時也屬上乘。蔣介石親自命名為“美齡號”，衣復恩也因為駕機技術出眾而成為專機的機長，不再接受其他任務。

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蔣介石的專機機長衣復恩永遠不會忘記這一天，一九四九年十二月十日，他駕駛著中美號，在成都的鳳凰山機場，載著蔣介石離開了大陸美好河山。衣復恩回憶說：“這是蔣介石從政生涯中最心酸的一刻，他坐在飛機上，一言不發。”

到臺灣後，衣復恩由中校一路升至中將，曾擔任空軍情報署長職務。1966年，由蔣經國調派擔任“國防部次長”，主管臺軍演習和各種訓練。

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當時，蔣介石、宋美齡夫婦身邊，有兩個親信人物。一是勵志社總幹事黃仁霖，人稱蔣宋的皮包；另一是“美齡號”與“中美號”（1946年，中國航空公司贈送更豪華的C-54座機，該機被命名為“中美號”）總統座機的座機長衣復恩，時人稱他為蔣宋的手杖。前者管錢物，後者管出行。

孰料，1966年7月，“國防部”軍法處的一張傳票，送到衣復恩手裡，說要他去“談話”。可是，當軍法處邀衣去“談話”時，竟無端把他扣留，這一“暫且扣留”，竟是1066天……無奈的衣復恩，在看守所裡每天以讀書消磨這長長的日子。

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多年之後，真正的原因才逐漸浮出水面。原來，衣復恩入獄，還是那句老話禍從口出！其一，心直口快的衣復恩跟隨蔣介石撤退臺北後，曾檢討在大陸失敗原因說，“在於我們自身的腐敗與無能”。其二，衣復恩對老蔣的“反攻大陸”說法持保留態度。他認為，“反攻大陸，希望渺茫。如今日能夠反攻成功，當年就不會撤守，兩岸未來只能和平統一！”他的這些觀點不僅觸及蔣氏父子的痛處，更加要命的是，他還把這觀點和當時美國“大使館”的林克斯談及，此後林克斯返回美國，在美國國會作證時，引用了他的談話。“臺灣駐美大使”秘密報告老蔣，這就犯了天下之大不韙。

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“失之東隅，收之桑榆”。衣復恩在軍界落馬，在商界卻大大成功。並在大陸的廣東佛山、惠州，陝西咸陽，上海等地投資辦廠。同時大陸的文教事業，在北大、清華設獎學金，並以母親之名在山東大學成立了“立青文教基金”。在通縣潞河中學建體育館，在山東平度縣高戈莊辦希望小學。從一九四九年闊別大陸，至一九八九年已整整四十年，衣復恩戀鄉情切，臺灣解除戒嚴後，於一九八九年回到杭州。西湖景色依舊，只是人事已非。二零零五年四月九日，衣復恩在臺北和信醫院安詳辭世，享年八十九歲。