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國際領先:FANSe演算法透過科技成果評價

2021-07-31由 美通社 發表于 科技

深圳2021年7月30日 /美通社/ —— 2021年7月13日,經科技部批准成立的第三方專業科技成果評價機構中科合創(北京)科技成果評價中心,組織專家以影片連線方式召開了科技成果評價會,對承啟張弓教授團隊完成的“全自主高效能高穩健的核酸測序快速比對演算法及雲分析系統”進行科技評價。經過專家評審,FANSe系列演算法同時達到了極高計算速度與準確性的雙重目標,具有超強的容錯能力及遠超傳統演算法的實驗可驗證性,在解決“ 精準醫學 不精準”的世界性難題上做出了重要的貢獻。作為可商用的基因資料底層比對核心技術,其比對精度比歐美演算法高出兩個數量級,其雲平臺的投入應用得到了使用者的一致好評,體現出良好的商業效益和社會效益。FANSe系列演算法完全自主研發,保障了中國的科研和精準醫學的獨立自主性。評價專家組一致認為,該專案具有很強的科學性、創新性和實用性,研究成果總體上達到國際領先水平。

這是國家權威機構對FANSe的“官方認證”

國際領先:FANSe演算法透過科技成果評價

FANSe演算法科技成果透過中科合創(北京)科技成果評價中心評價

目前,幾乎所有二代測序應用需要進行mapping(快速比對),鑑於所有生物學意義的分析都高度依賴於mapping的結果,尤其是存在於reads(短讀序列)中的錯配結果,因此mapping的速度和精度都很重要但速度與精度通常不可兼得,比如基於BWT原理的演算法速度提升,但對錯配的處理無法做到完美,在實際生物學應用中容易導致假陰性和假陽性問題,國際頂級科學雜誌Nature 斥之為“可重複性危機”( 2012年) 2017年,JAMA Oncology 雜誌釋出結果,將40份癌症病人樣本送給兩家世界知名測序公司進行測序,絕大部分樣本的兩份突變報告完全不同因此二代測序技術在臨床上亂象叢生,難以保證高通量下的準確性

為此,張弓教授開始研發FANSe演算法,力圖建立穩健精準的二代測序基礎技術2011年,FANSe1代研發成功,奠定了準確穩健的數學基礎,錯誤率可低至10-9以下,一定條件之下可以100%保證得到數學最優解2014年, FANSe2代研發成功,實現了並行化處理,同年開始部署在承啟生物的雲平臺上2015年起,高效能的FANSe3開始研發,2017年開始在國際權威科學期刊上亮相,2018年首次實現了單機1小時全基因組、1秒鐘全轉錄組的驚人分析速度2020年, 雲平臺專用的FANSe4代在承啟生物創造了單節點5分鐘分析完一個人全基因組測序資料集的新紀錄由於其強悍的效能和全自主的特點,FANSe被作為科技部國家重點研發計劃《醫學生命組學資料質量控制關鍵技術研發與應用》核酸測序的底層演算法,為 組學 領域的質控標準貢獻關鍵力量

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